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大连市疾病预防控制中心
大连市疾病预防控制中心是在卫生体制改革中于2002年2月6日在原大连市卫生防疫站、市劳动卫生研究所、市健康教育中心的基础上组建的新型综合性疾病预防控制机构，担负着疾病预防与控制、突发公共卫生事件应急处置、疫情报告及相关因素信息管理、健康危害因素监测与干预、实验室检测分析与评价、健康教育与健康促进、技术管理与应用研究指导的七大职能。
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中国疾病预防控制中心麻风病控制中心
中国疾病预防控制中心麻风病控制中心（以下简称“麻风中心”）座落在江苏省南京市紫金山北麓，前身为1954年在北京成立的“中央皮肤性病研究所”（即现在的“中国医学科学院中国协和医科大学皮肤病医院（研究所）”，以下简称“医科院皮研所”），直属卫生部领导，重点承担指导全国性病防治任务。
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望江县疾病预防控制中心
望江县疾病预防控制中心于2005年6月经县机构编制委员会批准成立，是县政府设立的实施国家疾病预防控制与公共卫生技术管理和服务的公益性事业单位,中心遵循预防为主的工作方针,应用预防医学理论和技术,开展疾病预防控制、疫情收集与报告、监测检验与评价、健康教育与促进、突发公共卫生事件处置等工作。
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中国疾病预防控制中心传染病预防控制所
传染病预防控制所（以下简称传染病所）是中国疾病预防控制中心领导下的国家级传染病预防控制专业机构，是全国传染病预防控制业务技术指导中心。
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西安市疾病预防控制中心
根据卫生部《关于卫生监督体制改革实施意见》的统一要求，经西安市政府、市编委批准，西安市疾病预防控制中心是在西安市卫生防疫站、西安市地方病防治所、西安市结核病防治所、西安市性病监测中心的基础上组建，于2002年9月30日正式挂牌成立，当年11月4日正式运行。
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中国疾病预防控制中心结核病预防控制中心
中国国家结核病预防控制中心的官方网站，提供全国结核病控制工作的交流平台。
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中国疾病预防控制中心慢性非传染性疾病预防控制中心
包括中心简介、组织机构、疾控动态、疾控信息、健康在线等内容。
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中国疾病预防控制中心寄生虫病预防控制所
中国疾病预防控制中心寄生虫病预防控制所，前身为中央卫生研究院华东分院，1950年建于南京，1956年定名为中国医学科学院寄生虫病研究所，1957年与中国医学科学院海南疟疾研究站合并，迁址上海，1983年划归中国预防医学科学院领导。2002年1月23日更名组建为中国疾病预防控制中心寄生虫病预防控制所。
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中国疾病预防控制中心性病控制中心
1994年卫生部在中国医学科学院皮肤病研究所调整成立了全国性病麻风病控制中心，麻风病研究室作为该中心的一个科室，在卫生部、医科院和所院（中心）的领导下，承担全国麻风病防治研究工作技术指导和防治效果评价，健康教育，业务指导和培训，疫情统计，监测和麻风专家咨询委员会日常工作等。1998年5月所院进行了机构调整，原性病和麻风病研究室撤消，下设中心办公室、疫情监测室、防治室、康复室、健康教育室和中心实验室。
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中国疾病预防控制中心精神卫生中心
2002年6月7日，卫生部批准中国疾病预防控制中心下设精神卫生中心，设在北京大学精神卫生研究所。2002年10月30日，中国疾病预防控制中心精神卫生中心在北京大学精神卫生研究所正式挂牌。
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